anche io ti direi la pasta termica,
però puoi provare a dargli una spolverata veloce con un compressore
stando attento a non insistere più di 1/2 secondi sulle ventole perché rischi di romperle
diciamo meno di 1 secondo (piuttoto ripassaci più volte).
Riesci a vedere:
a) se TUTTE le ventole girano, (almeno 1 generale dello chassis, 1 per ogni processore, forse 1 su SK madre etc...) magari si è rotta qualcuna di quelle
b) se c'è un particolare Processore che si scalda molto più degli altri (supponendo un sistema multiprocessore)
Poi eventualmente potresti provare 2/3 live diverse con dei test CPU intensive per vedere se il problema è legato al kernel linux della debian.
Giovanni